Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms