Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms