Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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