Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms