Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Defa35E9QLQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms