Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cald1E9QA15 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms