Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Simc1E9Q6E9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms