Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtproE9Q612 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtproE9Q612 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms