Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930546C10RikE9Q4Y3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930546C10RikE9Q4Y3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms