Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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