Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms