Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbf2E9PXF8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms