Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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