Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms