Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms