Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms