Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hfm1D3Z4R1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms