Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tgfbr3lD3YZZ2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tgfbr3lD3YZZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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