Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms