Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm17333C6EQI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17333C6EQI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm17333C6EQI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17333C6EQI3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm17333C6EQI3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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