Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nxpe3B9EKK6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms