Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms