Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms