Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms