Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6133B2RY53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms