Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms