Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia1B2RXQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia1B2RXQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms