Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms