Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms