Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf1bp1B2KF50 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms