Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms