Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms