Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms