Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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