Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm11127A7VMS2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11127A7VMS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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