Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms