Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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