Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms