Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms