Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms