Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms