Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms