Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn2aA0A0J9YTW6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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