Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms