Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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