Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trbv5A0A0B4J1G9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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