Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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