Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLPPQ16740 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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