Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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