Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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